人類が永きに亘って壁の中に隠してきた、大いなる秘密――。 その真実に一歩近づいた調査兵団だったが、 時の王政により反逆者の汚名を着せられてしまう。 しかし、人類はただ飼われるだけの家畜ではなかった。 真実を追い求めるエルヴィン・スミスの執念は兵団の トップを動かし、遂に現体制に対するクーデターが勃発する。 民衆を欺き続けた偽りの王は退き、 真の王家の血を引くヒストリア・レイスが即位。 自ら巨人を討ち果たした勇敢な女王のもと、 人類は新たな時代を迎えようとしていた。 エレン・イェーガーが得た硬質化の能力と、 そこから誕生した対巨人兵器。 着々と反抗の準備を進める人類は、 悲願のウォール・マリア奪還作戦を決行する。 人類と巨人、互いの生き残りを賭けた究極の戦い。 その先にエレンは、人類は、はたして何を手にするのだろうか？